Données d'imagerie ouverte pour la biologie – ScienceDaily

Une image peut valoir mille mots, mais seulement si vous comprenez ce que vous regardez. Les sciences de la vie reposent de plus en plus sur les données d'image 2D, 3D et 4D, mais leur hétérogénéité et leur taille sont extrêmement difficiles à regrouper dans une ressource centrale, à d'autres types de données et à partager avec la communauté de la recherche.

Pour relever ce défi, les scientifiques de l'Université de Dundee, de l'Institut européen de bioinformatique (EMBL-EBI), de l'Université de Bristol et de l'Université de Cambridge ont lancé un prototype de dépôt de données d'imagerie: la ressource de données d'image (IDR) . Cette ressource gratuite, décrite dans Nature Methods est le premier dépôt d'images biologiques générales qui stocke et intègre des données à partir de multiples modalités et laboratoires.

L'IDR révèle également l'impact potentiel du partage et de la réutilisation des données d'imagerie pour les sciences de la vie.

Mise en commun des ressources

«L'imagerie ne sera vraiment transformatrice pour la science que si nous rendons publiques les données», explique Alvis Brazma, auteur principal et scientifique principal chez EMBL-EBI. "Les scientifiques devraient être en mesure d'interroger les données existantes pour identifier les points communs et les modèles. Mais pour rendre cela possible, nous avons besoin d'une plate-forme robuste où les chercheurs peuvent télécharger leurs données d'imagerie et accéder facilement aux données d'autres expériences. La ressource de données d'image est la première étape vers la création Un référentiel public de données d'image pour les sciences de la vie. "

Il existe de nombreuses ressources dans le monde dans lesquelles les gens publient des données d'imagerie, mais aucune de ces …

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